ugünkü Eserönü mevkiinde yer alan kalıntılardan anlaşıldığı üzere, İnönü’nün ilk yerleşimcileri Friglerdir. Bölgede bulunan sütun başlıkları ve taş mimari unsurlar, antik bir yaşamın izlerini taşımaktadır. Bu, İnönü’nün binlerce yıllık bir tarihe sahip olduğunu göstermektedir.

Romalıların ardından bölge Bizans İmparatorluğu topraklarına katılmıştır. Günümüzde “İnönü Kalesi” olarak bilinen yapılar ve Kandilli Köyü’nden çıkarılan tarihi eserler, bu döneme ait yerleşimi belgelemektedir. Bu dönemden kalan izler, kasabanın adının o zamanlar “Basilika” olduğunu göstermektedir. Yerleşimin bugünkü konumuna, kayaların önüne doğru çekilmesi de bu döneme rastlamaktadır.

İnönü, Osmanlı idari sisteminde önce Anadolu Eyaleti’ne, ardından Hüdavendigar Vilayeti’ne, son olarak da merkezi Bilecik olan Ertuğrul Sancağı’na bağlı Söğüt kazasının bir köyü olarak yer almıştır. Bu dönemde küçük, fakat önemli bir yerleşim birimi olarak varlığını sürdürmüştür.

Kurtuluş Savaşı’nın çetin günlerinde, İnönü 1920 yılında Yunan kuvvetleri tarafından işgal edilmiştir. Bu işgal yaklaşık 16 ay sürmüş ve halk ağır bir dönemden geçmiştir.

Türk ordusu ile Yunan ordusu arasında geçen ve zaferle sonuçlanan bu savaş, Türk milletinin moralini yükseltmiş, direniş ruhunu güçlendirmiştir. Bu muharebe, İnönü’nün adını sadece haritalara değil, tarihin altın sayfalarına da yazdırmıştır.

Birinci zaferin ardından gelen bu ikinci büyük direniş, Türk ordusunun kararlılığını ve gücünü bir kez daha göstermiştir. Bu zaferle birlikte Mustafa Kemal, İsmet Paşa’ya bir telgraf göndererek şu ifadeleri kullanmıştır: “Siz orada yalnız düşmanı değil, milletin makus talihini de yendiniz.”

Yunan ordusunun İzmir’e çekilmesiyle birlikte İnönü, 4 Eylül 1922 tarihinde tamamen özgürlüğüne kavuşmuştur. Bu tarih, kasaba halkı için bir dönüm noktası olmuştur.

Cumhuriyetin ilanı sonrası idari düzenlemelerle birlikte İnönü, il yapılan Bilecik’in Söğüt ilçesine bağlı bir köy olarak yeniden konumlandırılmıştır.

Kısa bir süre sonra İnönü, Bilecik’ten ayrılarak Bozüyük ilçesine bağlanmış ve bucak merkezi haline gelmiştir.

İdari yapıdaki değişiklikle birlikte İnönü, Eskişehir ilinin merkez ilçesine bağlanmıştır. Bu süreç, İnönü’nün gelişimini hızlandırmıştır.

1987 yılında alınan kararla İnönü, Eskişehir’e bağlı bağımsız bir ilçe haline gelmiştir. Bu adım, bölgenin kalkınmasında önemli bir dönemeç olmuştur.

İnönü ismi bölgenin coğrafi yapısından gelir. Etrafında bulunan mağaralar, kayalıklar ve doğal oyuklar nedeniyle bu bölge tarih boyunca “inlerin önü” olarak anılmış, bu ifade zamanla İnönü adına dönüşmüştür.